Selasa, 14 Januari 2014
Referensi Software Kimia Lainnya
Referensi Software Kimia Lainnya
1.
FREQUINT
NMR SIMOLATOR
Sebuah
software yang dapat digunakan untuk simulasi NMR.
Diunduh
dari : http://users.ugent.de/~tkuppens/chem.shtml
2.
ChemSW
Mass Spec Calculator Profesional
ChemSW
Mass Spec Calculator Profesional merupakan sebuah software yang dapat digunakan
dalam Massa Spectroscopy ( Spektroskopi Massa ) .
Diunduh
dari : http://www.chemistry-software.com/
3.
ChemSW
ChemSite Standart Demo
ChemSW
ChemSite Standart Demo adalah software yang digunakan untuk mengambarkan
struktur molekul 3D dari senyawa karbon, Gula, Asam Amino, dan Asam nukleat.
Diunduh
dari : http://www.chemistry-software.com/
4.
ChemSW
Molecular Modeling Demo
Diunduh
dari : http://www.chemistry-software.com/
PERBEDAAN SISTEM OPERASI Windows dan Linux
PERBEDAAN SISTEM OPERASI Windows dan Linux
Linux dan Windows merupakan sistem operasi. Namun kedunya memiliki perbedaan. Nah berikut perbedaan diantara keduany.
Berikut ini adalah beberapa hal yang membedakan sistem operasi windows dan linux :
1. Hak Atas Kekayaan Intelektual (HAKI)
Jika dilihat dari sisi HAKI, SO Windows dan kebanyakan program-program aplikasinya, kepemilikan lisensi (rata-rata berharga $200 USD) merupakan sarat mutlak untuk penggunannya.
Sementara Linux dan program-program aplikasinya dilain pihak berlisensi gratis dan justru mendorong para penggunanya untuk menyebarluaskan perangkat lunak tersebut.
2. Instalasi dan Kelengkapan Program
Windows adalah sistem operasi, itu sebabnya Windows tidak menyediakan banyak program setelah diinstal. Kalaupun ada mungkin Anda hanya akan menemukan Internet Explorer, Media Player, Notepad, dan beberapa program kecil lainnya.
Ini sangat berbeda dengan Linux. Sekalipun Linux juga suatu sistem operasi, tetapi Linux disertai dengan banyak program didalamnya. Setelah diinstal, Anda akan menemui banyak program dari hampir semua kategori program. Sebut saja kategori Office Suite, Multimedia (Sound, Video, Graphics), Internet (Browser, Email, Chat, Downloader, Messenger, Torrent, News), 3D, Games, Utility, dll.
Linux dan Windows merupakan sistem operasi. Namun kedunya memiliki perbedaan. Nah berikut perbedaan diantara keduany.
Berikut ini adalah beberapa hal yang membedakan sistem operasi windows dan linux :
1. Hak Atas Kekayaan Intelektual (HAKI)
Jika dilihat dari sisi HAKI, SO Windows dan kebanyakan program-program aplikasinya, kepemilikan lisensi (rata-rata berharga $200 USD) merupakan sarat mutlak untuk penggunannya.
Sementara Linux dan program-program aplikasinya dilain pihak berlisensi gratis dan justru mendorong para penggunanya untuk menyebarluaskan perangkat lunak tersebut.
2. Instalasi dan Kelengkapan Program
Windows adalah sistem operasi, itu sebabnya Windows tidak menyediakan banyak program setelah diinstal. Kalaupun ada mungkin Anda hanya akan menemukan Internet Explorer, Media Player, Notepad, dan beberapa program kecil lainnya.
Ini sangat berbeda dengan Linux. Sekalipun Linux juga suatu sistem operasi, tetapi Linux disertai dengan banyak program didalamnya. Setelah diinstal, Anda akan menemui banyak program dari hampir semua kategori program. Sebut saja kategori Office Suite, Multimedia (Sound, Video, Graphics), Internet (Browser, Email, Chat, Downloader, Messenger, Torrent, News), 3D, Games, Utility, dll.
Senin, 13 Januari 2014
Instalasi Android SDK
.1. Klik
Windows-> preferences pada Eclipse.
2. Pilih android pada
menu sebelah kanan, kemudian browse path/Folder Android- SDK yang sudah di ekstract.
Mengkonfigurasikan AVD
AVD(Android Virtual Devices)
merupakan emulator yang berguna untuk menjalankan program android yang kita
buat tanpa perlu untuk menggunakan handphone/tablet android sungguhan. Berikut
langkah-langkah untuk membuat AVD pada Eclipse.
1. Klik Windows -> AVD Manager.
2. Klik
New untuk membuat AVD Baru.Instalasi ADT
1. Pada Eclipse klik
help->install new software.
2. Klik Add,
lalu pada Name ketik android dan pada Location klik Archive. Selanjutnya pilih
ADT (.zip) untuk melakukan instalasi Android Development Kit, klik
select all dan next.
Membuat struktur kimia (menggambar geometri molekul) menggunakan xdrawchem
WinDrawChem adalah program gratis (freeware) yang dapat digunakan untuk menggambar strukrus molekul dalam dua-dimensi. WinDrawChem dapat diinstal di sistem operasi Windows 95/98/NT/2000/XP , Linux, Unix, FreeBSD. Hal ini mirip dalam hal fungsionalitas dengan program menggambar molekul lain seperti ChemDraw (TM, CambridgeSoft). Hal ini dapat membaca dan menulis Molfiles MDL untuk memungkinkan sharing antara XDrawChem dan aplikasi kimia lainnya, serta membaca biner dan file teks ChemDraw.
Fitur WinDrawChem termasuk:
Kompatibel dengan OS UNIX / Linux / FreeBSD/Windows
Mendeteksi struktur, teks, dan panah dan menempatkan mereka secara otomatis. Serta mampu menyelaraskan panjang, dan sudut agar tetap simetris.
Dapat membaca dan
menulis Molfiles MDL, dan dapat mengekspor gambar yang didesain sebagai file
gambar dengan ekstensi jpg.
Penggunaan JMOL
cara menggunakan aplikasi ini dalam linux adalah
sebagai berikut:
·
nyambung dulu ke internet
·
install aplikasinya lewat terminal ketik sudo apt-get
install jmol
·
setelah proses selesai, cek buka science, kemudian
coba gunakan deh…
1. Halaman yang pertama muncul adalah sebagai berikut:
Aplikasi Easychem Chemical Structure
Aplikasi Easychem Chemical Structure
EasyChem is a program that helps you creating high quality diagrams of molecules and 2D chemical formulas that can be exported to PDF, PS, LaTeX and fig.EasyChem was originally developed to create diagrams for chemistry books and is now frequently used for this purpose in commercial and non-commercial chemistry-related books.
cara meng-install easychem chemical structures
1.sudo apt-get update
2.sudo apt-get install easychem chemical structures
APLIKASI GAMGI
GAMGI adalah sebuah pernagkat lunak open source untuk penciptaan dan analisis
struktur atom.GAMGI adalah sebuah program ntuk membangun,melihat,dan
menganalisis struktur atom sperti molekul,kristal,gelas,cairan,dll.Ini
bertujuan untuk menjadi berguna untuk masyarakat ilmiah yang bekerja di
Permodelan Atomistik yang membuthkan grafis antarmuka untuk membangun input data dan untuk melihat dan menganalisis data output,di
hitung dengan AB intio dan Molekuler Mekanika program,komunitas ilmiah
dibidang kimia belajar yang besar,fisika,ilmu material,geologi,dll,yang
membutuhkan antarmuka grafis untuk melihat dan menganalisis atom
struktur informasi dan untuk mempersiapkan gambar untuk presentasi
dikelas dan seminar,mengajar kimia dan fisika di sekolah menengah dan
perguruan tinggi,ilmu promosi di sekolah-sekolah,pameran dan museum ilmu
pengetahuan.
APLIKASI CHEMTOOL
Chemtool adalah program untuk menggambar
struktur terutama senyawa organik. Chemtool mudah digunakan untuk menggambar
selain terdapat tools untuk menghitung massa molekular. Instalasi chemtool
sangat mudah karena beberapa distro besar memasukkan chemtool ke dalam
repository mereka. Bahkan instalasi dari source codenya pun juga mudah. Nah
sekarang ayo kita belajar cara menggunakan aplikasi chemtool. Pertama ketika
Anda membuka aplikasi chemtool maka muncul tampilan seperti di bawah ini:
Chem office
Chem Office merupakan salah satu software yang
digunakan untuk membuat struktur kimia dengan mudah. Sofware ini banyak memilki
kelebihan untuk mempermudah kita menggambar rumus kimia. Untukmenggambar rumus
molekul kimia Chem Office menyertakan Chem Draw dan Chem 3D.
Chemdraw merupakan software kimia dari produk
Cabridgesoft.inc. ChemDraw memiliki banyak fungsi, diantaranya membuat nama dan
struktur senyawa, membuat struktur streokimia dengan benar dari nama kimia,
menghitung rumus molekul dan berat molekul, dan mendapatkan nama IUPAC dengan
akurat dari struktur. Perkiraan spektra NMR dari struktur suatu senyawa dengan
atom langsung dengan korelasi spektral. Selain itu, ChemDraw dilengkapi dengan
peringatan jika terjadi kesalahan dalam pembuatan struktur kimia. Peringatan
tersebut biasanya berwarna merah dan mengelilingi bagian struktur yang salah.
BKChem (Edit Chemical Structures and reactions)
BKChem (Edit Chemical Structures and reactions)BKChem adalah software Ubuntu untuk pelajaran kimia yang dikemas dengan fitur. Mendukung, menurut tim pengembang website: gambar ikatan molekul, panjang ikatan dan pembatasan sudut untuk membantu dengan gambar, siap untuk menggunakan template umum, mendukung warna, grafik vektor sederhana (persegi panjang, lingkaran, poligon, dan lain – lain) serta lainnya.
Aplikasi Kimia di Ubuntu
Kembali otak-atik Ubuntu Linux. Fokusnya adalah optimalisasi kemampuan ubuntu untuk pengajaran kimia dan ilmu kimia sendiri. Dari list synatic package manager (SPM) ubuntu cukup banyak aplikasi terkait kimia yang memungkinkan digunakan dalam mendukung pembelajaran kimia di sekolah.
Beberapa deskripsi aplikasi-aplikasi tersebut sebagai berikut:
Xdrawchem (Chemical structures and reactions editor)
Xdrawchem adalah editor 2D untuk struktur dan reaksi kimia. Kemampuannya merupakan bayangan program komersial ChemDraw, terutama untuk 2D-nya.
GChempaint (2D chemical structures editor for the GNOME2 desktop)
GChempait adalah aplikasi yg mirip dengan Xdrawchem, namun ditambah dengan kemampuannya membuat dokumen dengan berbagai interface. Gambar berbagai molekul hasil GChempaint ini dapat disearch pada NIST Webbook and PubChem.
Chemtool (Chemical structures drawing program)
Beberapa deskripsi aplikasi-aplikasi tersebut sebagai berikut:
Xdrawchem (Chemical structures and reactions editor)
Xdrawchem adalah editor 2D untuk struktur dan reaksi kimia. Kemampuannya merupakan bayangan program komersial ChemDraw, terutama untuk 2D-nya.
GChempaint (2D chemical structures editor for the GNOME2 desktop)
GChempait adalah aplikasi yg mirip dengan Xdrawchem, namun ditambah dengan kemampuannya membuat dokumen dengan berbagai interface. Gambar berbagai molekul hasil GChempaint ini dapat disearch pada NIST Webbook and PubChem.
Chemtool (Chemical structures drawing program)
Sabtu, 11 Januari 2014
Cara Mudah Menginstall Java di Linux
Java tu apa
c?pasti bertanya-tanya awalnya,,karena saya pun begitu…namun setelah
menginstallnya di Linux saya jadi mengerti apa itu fungsinya. DEngan
menginstall Java saya bisa melihat molekul dari aplikasi-aplikasi kimia yang
ada di Linux yang dapat bergerak dan berputar-putar…bagus deh pokoknya :)…kalau
ga salah saya melihat molekul itu di blog dosen ICT saya…
Setelah kita sudah banyak mempelajari tentang
Linux,,aplikasi-aplikasinya,,cara menoprasikan dan menggunakannya…sekarang saya
akan menunjukkan bagaimana cara menginstall Java yang mudah….
Langkah pertama yang haru dilakukan adalah,,silahkan
anda download di situs oracle jangan lupa untuk memilih versi Linux. Setelah berhasil di download,
silahkan ikuti cara-cara di bawah ini :
KSTARS
KStars
merupakan program yang sangat bagus di Linux, tidak hanya untuk
pendidikan, tapi juga untuk pemerintahan, keagaman, dan masyarakat
luas. KStars disebut juga Desktop Planetarium, artinya alat untuk
mengamati benda-benda di langit atau planet-planet, dalam bentuk
program di komputer desktop. Kita dapat menentukan dengan tepat letak
sebuah planet atau bintang, jam berapa bintang itu terbit dan
tenggelam dilihat dari bumi, dan sebagainya.
pendidikan, tapi juga untuk pemerintahan, keagaman, dan masyarakat
luas. KStars disebut juga Desktop Planetarium, artinya alat untuk
mengamati benda-benda di langit atau planet-planet, dalam bentuk
program di komputer desktop. Kita dapat menentukan dengan tepat letak
sebuah planet atau bintang, jam berapa bintang itu terbit dan
tenggelam dilihat dari bumi, dan sebagainya.
Molecule Viewer
Molecule Viewer merupakan aplikasi kimia yang cukup simple karena fitur dalam aplikasi ini cukup sedikit. Kita dapat menggunakannya apabila kita telah menyimpan file molekul sebelumnya dan ingin melihat bentuk molekul yang telah kita simpan. Ada Ball and Sticks, Space Filling, Cylinders, dan Wireframe.
Saya memakai bentuk molekul H2SO4 yang sudah saya buat melalui aplikasi Avogadro.
Boraks, Rumus Kimia, Rumus Struktur, dan Cara Menggambarkannya
Boraks di masyarakat sangat terkenal,
semenjak banyaknya orang yang menyalahgunakan benda ini pada makanan untuk
tujuan pengawetan pada makanan. Bahkan boraks jauh lebih terkenal dibandingkan
nama kita :).
Rumus
Struktur Boraks, dari http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=6432057
Boraks adalah nama dagang dari natrium
tetraborat dekahidrat (Na2B4O7·10H2O).
Juga dikenal sebagai: B4-Na2-O7, disodium [oxido(oxoboranyloxy)boranyl]oxy-oxoboranyloxyborinate. Rumus Molekulnya: B4Na2O7. Berat molekulnya: 201.219339
Juga dikenal sebagai: B4-Na2-O7, disodium [oxido(oxoboranyloxy)boranyl]oxy-oxoboranyloxyborinate. Rumus Molekulnya: B4Na2O7. Berat molekulnya: 201.219339
Reaksi antara boraks
(natrium tetraborat dekahidrat) dengan asam seperti asam klorida menghasilkan
asam borat.
MENGGUNAKAN APLIKASI AVOGADRO
Avogadro adalah software kimia gratis, open source, tersedia dalam berbagai paltform sistem operasi merupakan editor molekul yang dirancang untuk digunakan secara fleksibel dalam kimia komputasi, pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya. Avogadro yang tersedia dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X. Kode sumber sumber tersedia di bawah GPL GNU. Menurut saya aplikasi ini sangat bagus dengan kelebihan ukuran filenya sangat kecil (tidak lebih dari 10 MB). Tampilan yang bagus dan sudah bisa dihandle oleh perangkat keras kebanyakan sekarang.
Apa yang dapat dilakukan Avogadro?
- Dapat melakukan pengunduhan secara langsung dari PDB (protein data bank) atau PubChem (database dari molekul kimia dan aktivitasnya terhadap uji biologis)
- Inovatif “auto-optimation”, alat yang memungkinkan Anda untuk terus membangun dan memodifikasi, selama optimasi mekanika molekular.
- Antarmuka untuk banyak paket komputasi umum.
- Plugin yang memungkinkan Avogadro untuk diperpanjang dan disesuaikan.
- Embedded interpreter Python.
APLIKASI BKCHEM UNTUK MEMBANTU PEMBELAJARAN IKATAN KIMIA.
BKchem adalah aplikasi kimia yang bisa diinstall dalam linux Blankon dan bisa digunakan untuk membantu penggunanya dalam membuat struktur kimia yang rumit.
Dalam blog ini saya membuat reaksi tentang sulfonasi naftalena yang dapat memberikan 2 produk yang mungkin.Nah, inilah tampilan Default BKchem
Struktur naftalena adalah dua cincin benzena yang menempel. Untuk
menggambar cincin benzena maka klik ikon seperti cincin heksagonal. Klik dua
kali pada lembar berwarna putih seperti pada gambar di bawah ini.
Jumat, 10 Januari 2014
10 Software Terkait Pembelajaran Kimia
untuk mendukung pembelajaran kimia dengan materi struktur lewis, ikatan ion dan kovalen ada beberapa aplikasi pendukung.
Berikut adalah Cara atau tutorial penggunaan Software yang dapat digunakan untuk mendukung proses pembelajara kimia pada bab ikatan kimia.Silahkan di download, gratis tanpa dipungut biaya.
1.Avogadro
http://www.ziddu.com/download/23434333/CARAMENGGUNAKANAPLIKASIAVOGADRO-Copy.docx.html
2.BKChem
http://www.ziddu.com/download/23434343/CARAMENGGUNAKANAPLIKASIBKCHEM.docx.html
Tips Membuat Ikatan Rangkap O=C di ChemSketch
Menggambarkan rumus struktur pada
ChemSketch bagi sebagian orang yang menggeluti ilmu kimia tak semudah
menggambarkannya dengan alat tulis manual. Padahal teknologi komputer dibuat
adalah untuk memudahkan kerja sehingga lebih efektif dan efisien, praktis. Ini
adalah soal kebiasaan saja.
Seperti halnya menggambarkan ikatan
rangkap (double bond), saya contohkan adalah membuat ikatan rangkap antara C=C
pada etena atau etuna yang mempunyai ikatan rangkap tiga (triple bond). Setelah
membuat ikatan tunggal, dengan klik sekali dan seret kemudian lepaskan jadilah
struktur CH3-CH3, untuk membuatnya ikatan rangkap tinggal klik sekali pada
ikatan antara C-C maka akan menjadi ikatan rangkap C=C, kalau dikehedanki
ikatan rangkap tiga, klik sekali lagi pada ikatan rangkap tadi, jika mau
mengubahnya menjadi ikatan tunggal klik lagi sekali pada ikatan rangkap tiga
tadi. Mudah, tinggal klik-klik saja.
Pengenalan Model Zig-zag dalam Menggambar Struktur Rantai Karbon
Bahasan senyawa karbon di buku-buku kimia
sma selama ini masih belum banyak mengenalkan metode penulisan rantai karbon
model zig-zag. Setahu saya pada buku kimia kelas 10 terbitan depdiknas (buku
sekolah elektronik) hanya 1 buku dari 7 buku yang mengenalkan penulisan model
zig-zag pada rantai karbon. Hanya dua buku yang menuliskan rumus struktur
senyawa hidro karbon menggunakan software khusus untuk penggambaran rumus
struktur kimia. Selebihnya menuliskannya secara manual menggunakan aplikasi
olah kata. Bisa dibayangkan betapa melelahkannya melakukan cara manual seperti
itu.
Pemodelan Molekuler dengan Tinker via FFE (Force Field Explorer)
Molekul
enkephalin
Ada beberapa aplikasi untuk pemodelan
molekuler, beberapa di antaranya sudah sedikit saya tulis di blog ini. Kali ini
saya akan melirik sekilas dan menuliskannya di sini tentang Tinker.
Tinker adalah aplikasi pemodelan molekul
yang aslinya tanpa GUI (Graphical User Interface). Jadi hanya dengan
mengahadapi layar kosong dengan kedipan kursor saja. Bagi kita yang belum
familiar tentu akan banyak mengalami kesulitan dalam menggunakannya. Oleh
karena itu kini sudah ada yang menyediakan Tinker dengan GUI yang dinamakan
Force Field Explorer (FFE). Selama pengembangannya tentu saja dilakukan perbaikan
terus menerus dan kita yang menikmati untuk menggunakannya. GUI dari Tinker ini
dibangun melalui pemrograman Java, namun dalam paket installernya juga sudah
tersedia installer java yang dijanjikan tidak mengganggu kinerja Java yang
sudah kita install sebelumnya.
Optimalisasi Penggunaan Kalzium dalam Pembelajaran Kimia (#3)
Kalkulator molekuler Kalzium merupakan
salah satu fitur alat (tool) yang ada
pada Kazium. Sangat sesuai digunakan untuk
teman belajar bagi siswa untuk mengecek ulang hasil kerjanya sehingga diperoleh
jawaban yang tepat selama berlatih mengerjakan soal.
Kalkulator ini memiliki fungsi untuk
melakukan perhitungan dengan berbagai tugas, di antaranya penghitung massa
molekuler (MolecularMassCalculator),
penghitung konsentrasi (Concentrasions
Calculator), penghitung yang ada kaitannya dengan inti atom (Nuclear Calculator), penghitung gas (Gas Calculator). Sementara
ini penyeimbang perasamaan reaksi (Equation
Balancer) diletakkan pada tool yang berbeda.
Download Beberapa Molekul dengan File *.pdb dan *.xyz
Kepada sesupuh guru kimia komputasi saya
di Universitas Gadjah Mada (Prof. Harno DP, Dr. Ria Armunanto, Dr, Iqmal Tahir)
dan temen plus guru saya juga (Pak
Kasmui di UNNES, Pak Ponco Iswanto di Unsoed, Pak Yahmin di UNM, Pak Wayan
Sutapa di UNPATTI Ambon), mohon koreksi jika ada yang keliru dalam pembahasan
setiap tulisan di blog ini yang terkait kimia komputasi.
File pdb (protein data bank) dan xyz
adalah file tentang pemodelan molekul yang berupa struktur data koordinat
atom-atom dalam molekul secara 3 dimensi (3D) dengan pengarutan parameter
tertentu. File ini dapat dibuka dan diedit untuk tujuan tertentu dengan
menggunakan beberapa software kimia. Namun kebanyakan untuk aplikasi kimia
viewer molekul sudah bisa digunakan untuk menampilkan file-file tersebut.
Seperti Hyperchem, ChemSketch (dengan 3D Viewernya) JMol, Rasmol, dan
lain-lainnya. Beberapa dari software yang saya sebut sudah sedikit saya tulis
tutorialnya.
Cara Mudah Menyisip Jmol ke dalam Tulisan di Website atau Blog.docs
Tanpa
tahu bagaimana mengatur parameter atau menyeting apapun dibelakang aplikasi
Jmol, kita yang hanya ingin menampilkan suatu molekul atau beberapa molekul
cukup hanya menggunakan beberapa pengkodean saja seperti yang sedikit saya tulis di sini. Berikut ini cara
mudah menyisip JMol ke dalam tulisan kita di website atau blog sendiri
yang saya ambil dari Jmol
wiki.
Kita
dapat menyisip sebuah Jmol applet ke dalam halaman web hanya dengan tag simpel
<script> atau <a>. Kita tidak perlu lagi menginstal file-file Jmol
di web server. Kita tidak pula perlu membuat file model 3D; ia akan secara
otomatis dapat diperoleh dari web server tertentu yang memang menyediakan itu
:).
Catatan
bahwa ini merupakan penggunaan Jmol secara
mudah yang kompatibel dengan lingkungan di mana kita tidak mengontrol
source code lengkap, seperti forum, blog, wiki, sistem manajemen konten CMS,
lingkungan e-learning
Ada
beberapa alternatif bagaimana cara menampilkan model molekul, pertama kita
dapat memanggil dengan menggunakan id
dari PDB (protein data bank), model ini akan diambil dari wwPDB
(RCSB), kedua jika kita memanggil dengan menggunakan nama
kimia, nama komersial, string SMILES, InChI key, atau nomor registry CAS
registry, maka model akan diambil dari CACTVS
server (NIH).
Akan
saya contohkan bagaimana menggunakan cara-cara itu di sini.
Cara Mudah Membuat Sendiri Gambar Bentuk Molekul
Membuat
gambar (menggambar) bentuk molekul secara sesuai dengan ide sendiri sering
menjadi keinginan banyak orang terutama yang berkecimpung dalam bidang yang ada
kaitannya dengan kimia. Intinya menuangkan ide sesuai pemahaman. Gambar-gambar
bentuk molekul di jagad maya sangat banyak sekali, tinggal ketika nama molekul
ditambahi beberapa istilah seperti shape, geomteri, bentuk, struktur atau
apapun yang mengarah ke bentuk molekul dijamin ketemu. Hanya saja sering itu
tidak pas dengan maunya kita . Kadang kita menghendaki mestinya begini atau
begitu jadi perlu disesuaikan, tapi kalau gambar itu buatan orang lain tentu
tak semudah itu kita mengubahnya. Oleh karena itu dengan sedikit trik kita
dapat “sedikit” membuat gambar bentuk molekul tertentu.
Menggambar Bentuk Molekul dengan menggunakan Hyperchem 8
Hyperchem
adalah salah satu aplikasi kimia komputasi yang relatif mudah untuk digunakan
karena sifatnya yang langsung bisa menunjukkan tampilan dari apa yang hendak
kita buat. Meskipun demikian ini hanyalah sekelumit tentang kemampuan Hyperchem
yang bisa dimanfaatkan dalam pembuatan media belajar yang sederhana namun
secara komputasi kimia dibenarkan. Tentu saja kalau semua kita lakukan dengan
benar, tidak asal gambar, seperti sebelum menggunakan software layaknya
Hyperchem ini.
Visualisasi Atom, Molekul, & Ikatan Kimia yang Benar
Teknologi yang semakin canggih membuat semua yang
semula hanya dibayangkan dalam angan-angan bisa digambarkan dengan benar
menurut kimia komputasi. Kimia komputasi adalah salah satu cabang ilmu kimia
tepatnya kimia teori yang didasarkan fakta nyata dengan mengkombinasi kan
matematika, algoritma, dan komputer untuk menghitung sifat suatu spesies
(molekul dan lain-lain). Dari hasil itulah maka diperoleh gambaran suatu zat
yang “nyata adanya”. Bahkan karakter suatu spesies itu dapat dibuat
simulasi pergerakannya berupa animasi (gambar bergerak seperti gambar di
samping). Animasi semacam itu bukanlah rekayasa biasa, namun telah melalui
tahap optimasi geometri secara komputasi dengan metode tertentu.
Shortcut Penting pada ChemSketch
C
|
hemSketch adalah aplikasi penampil struktur molekul
yang bersifat freeware (gratis download, gratis pakai). Bagi guru kimia
sepertinya ini adalah aplikasi wajib yang harus digunakan untuk mendukung
pekerjaannya. Apalagi kalau guru kimia lebih sering menggunakan komputer dalam
mengajar. Penggunaannya relatif mudah, mudah kalau sudah terbiasa :).
Bayangkan saja kalau ingin menggambar struktur senyawa
karbon dengan menggunakan aplikasi olah kata, ini justru akan sulit, lebih
sulit dari menggambar menggunakan alat tulis konvensional :). Aplikasi olah
kata memang bukan diperuntukkan menggambar struktur kimia, jadi fasilitas untuk
itu jelas tidak tersedia.
Bagi kita yang sering akan menggunakan aplikasi
ChemSketch ini sebaiknya membuat shortcut keyboard untuk membuka ChemSketch,
atau membuat shorcut pada Taskbar (deretan bawah dari layar komputer kita)
sehingga kapanpun kita bisa membukanya dengan sekali klik. Saya lebih suka
memasangnya pada Taskbar.
Pemanfaatan Java Applet untuk Pembelajaran Kimia
Java applet adalah sebuah program kecil yang
ditulis dengan menggunakan bahasa pemrograman Java, yang diakses
melalui halaman Web dan dapat diunduh ke dalam mesin
klien yang kemudian menjalankannya di dalam jendela penjelajah
web. Java applet dapat secara dinamis menambahkan beberapa fungsi
kepada halaman-halaman Web yang bersifat statis. Akan tetapi, untuk
menjalankannya sebuah komputer harus memiliki program penjelajah web yang dapat
menjalankan Java. Sumber id.wikipedia.org.
Optimalisasi Penggunaan Kalzium dalam Pembelajaran Kimia (#1)
Apa itu
Kalzium? Apakah tulisan itu tidak salah, bukannya kalsium tulisan yang benar? Kalau yang dimaksud adalah unsur
kalsium yah memang salah, tapi Kalzium adalah nama sebuah software (open
source software - OSS) yang memanfaatkan tabel periodik untuk
mengeksplorasi setiap unsur. Tapi ternyata tidak sekedar tabel periodik biasa,
lebih dari sekedar tabel periodik. Kalzium berasal dari bahasa Jerman dari kata
kalsium. Saat ini Kalzium sampai di versi Hidrogen. Untuk diketahui semenjak
Kalzium menjadi aplikasi standalone ia versinya akan dinamai dengan
urutan nama unsur dalam tabel periodik.
Apa sajakah
yang bisa digunakan dari kalzium dalam pemebelajaran kimia sma? Materi-materi
pelajaran kimia, baik di kelas 10, kelas 11 IPA, maupun kelas 12 IPA bab-bab
tertentu sangatlah tepat memanfaatkan kehebatan Kalzium. Tentu ini hanya
merupakan alternatif dalam penggunaan media pembelajaran. Sampai saat ini
Kalzium belum mendukung untuk sitem operasi Windows. Hanya bisa berjalan untuk
sistem operasi Linux. Oleh karena itu di sarankan pengguna yang ingin
mencobanya sebaiknya meningstall sistem operasi Linux di komputernya. Toh ini
barang gratis dan halal. Masih enggan menggunakan linux alasan tidak bisa?!
Bukan jamannya lagi, Linux semakin mudah digunakan dan user friendly atuh.
Tetap ngeyel?! Yah sudah gunakan alat seperti ini (atau semacam virtual mesin)agar kalzium bisa jalan di
Windows kesayangan anda.
Struktur Molekul 2D dan 3D secara Daring
Begitu ketemu, aha…! Ini dia, alternatif cara praktis
yang bisa dimanfaat guru kimia untuk membuat model molekul secara simpel. Cukup
sediakan koneksi internet yang memadai dan klik situs yang ada di paragraf
kedua tulisan ini. Simpel karena hanya dengan beberapa kali klik saja model
yang diharapkan untuk dibuat segera jadi, tentu tidak asal sembarang jadi
menggambar karena melalui tahap optimise (optimasi). Bebeda sekali kalau
dibandingkan dengan menggunakan aplikasi luring yang cenderung relatif berat,
meskipun tetap ada fleksibilitasnya.
Saudara yang segera ingin tahu, boleh langsung menuju
ke TKP: biomodel.uah.es. Situ ini aslinya berbahasa Spanyol, tapi jangan
kuatir khusus untuk SketchEl yang dikombinasi dengan JMol ini ada dalam bahasa
antarmuka berbahasa Inggris. Berikut tampilannya:
Menggambar Struktur Lewis Menggunakan ChemSketch
Penggambaran struktur molekul menurut Lewis (aka
struktur Lewis) merupakan gambaran yang masuk akal yang bisa diterima selama
ini. Visualisasinya biasanya menggunakan dot atau tanda x atau yang lain, juga
boleh menggunakan variasi warna. Tujuan penggambaran ini hanyalah untuk
memudahkan siapa saja yang ingin memahami struktur atom atau molekul.
Jika ingin mengambarkan struktur Lewis secara manual
tidaklah sulit. Namun pada saat menuliskan/menggambar dengan program olah kata
itu akan menyulitkan. Oleh karena itu akan lebih mudah kalau menggunakan
perangkat lunak pendukung yang khusus. Misalnya dengan menggunakan Chemsketch.
Penggunaan ChemSketch untuk menggambar struktur Lewis
sangat mudah. Di situ sudah tersedia beberapa model dan kita bisa
menambahkannya sendiri sehingga pada saat diperlukan kita tinggal klik saja.
Menggambar Hidrokarbon dengan ChemSketch
Bahasan hidrokarbon pada kelas X sma diperlukan tenaga
ekstra. Apalagi kalau sarana yang digunakan hanyalah berupa spidol dan papan
tulis, harus menulis rumus molekul, kemudian menggambar lagi rumus molekul. Selain
itu juga diperlukan kemampuan guru menulis di papan tulis dengan bagus dan juga
menggambarkannya. Jika tidak maka menjadi tidak menarik lagi oleh siswa.
Beruntung ada sarana komputer, proyektor, dan ada perangkat lunak yang bisa
digunakan untuk menjelaskan tentang bahasan kimia karbon, terutama yang terkait
rumus molekul, keisomeran dan lain-lain.
Secara langsung kita bisa membuat rumus molekul
atau rumus struktur, dari 2 dimensi (2D) diubah menjadi 3 dimensi (3D)dengan
beberapa pilihan model tampilan. Pada Chemsketch tersedia tampilan wireframe,
ball & stikcs, stikcs, spacefill, dots only, disk, with dots.
Membuat Struktur Lewis dengan Marvin Sketch
Marvin
Sketch adalah salah satu aplikasi powerfull yang dapat digunakan sebagai
fasilitas mengajar atau membuat teks yang terkait visualisasi atau penggambaran
suatu atom, ion, molekul, termasuk ikatan kimia yang terjadi di dalamnya.
Siapapun yang berhubungan dengan kimia akan banyak terbantu dengan aplikasi
ini. Dengan tampilan sederhana ternyata tersembunyi tool-tool (alat) yang
hebat. Sengaja oleh pengembangnya tidak ditampilkan secara lengkap, tujuannya
aga end user (pengguna) dapat melakukan customize (penyesuaian sesuai dengan
keperluan). Oh ya kalau maudownload Marvin Sketch silahkan klik di sini. Jangan lupa beri tanda centang pada “I Accept the
License Agreement”. Kalau diperlukan register silakan register dulu, gratis
kok.
Animasi Vibrasi Molekul dgn Hyperchem 8.03
Membuat
Animasi Vibrasi Molekul dgn Hyperchem 8.03
Membuat animasi suatu molekul tidak bisa disamakan
dengan membuat animasi biasa. Semua proporsi gerakan harus terhitung dengan
tepat. Walaupun sampai dengan saat menulis ini saya juga belum bisa membuat satupun
animasi biasa yang menarik. Tapi dengan program hyperchem saya sedikit bisa
membuatnya dengan hanya klak-klik sana sini. Ok langsung tancap gas aja deh…
Diasumsikan pada komputer telah terinstall program
hyperchem, microsoft office powerpoint ditambah add-ins liveweb for powerpoint.
- Buka program hyperchem yang terinstal
- Buat model molekul tertentu, saya contohkan membuat ‘Alanin’ yang bisa diambil dari Menu Databases > Amino acid…>> klik ‘Ala’ > tutup tampilan jendela pop-up.
MarvinSketch untuk Pengajaran Kimia
MarvinSketch
untuk Pengajaran Kimia
Banyak hal yang bisa
dimanfaatkan dari MarvinSketch untuk pengajaran kimia. Gambar
dan animasi molekul dapat dibuat dengan mudah. Selanjutnya dapat disisipkan
dalam media pembelajaran kimia. Tutorial berupa video untuk mengefektifkan
MarvinSkecth dapat dilihat atau diunduh
dari sini. MarvinSketch adalah software kimia
hanya untuk visualisasi rumus struktur kimia yang gratis, bisa dijalankan di
sistem operasi Windows dan Linux juga MacOS. Mau mencicipinya silahkan unduh
dari web ChemAxon ini.
Menggambar Rumus Struktur dengan ChemSketch
Menggambar
Rumus Struktur dengan ChemSketch
Kepada Pak Hadi Guru Kimia MAN di Bengkulu dan
siapapun pembaca yang memerlukan, berikut ini sedikit tutorial untuk bisa
menggambar rumus struktur beberapa senyawa hidrokarbon dengan menggunakan ChemSketch, dan
menyalinnya ke dalam berkas microsoft word.
Cara menggambar rumus struktur senyawa hidrokarbon
dengan menggunakan ChemSketch adalah sebagai
berikut:
- Buka ChemSketch dari Star-Program-ACDLabs12-Chemsketch. Pada keadaan standar (default) ChemSketch dalam mode Structure.
Struktur Lewis
Struktur Lewis
Struktur
Lewis adalah diagram yang menunjukkan ikatan-ikatan antar atom dalam suatu molekul. Struktur Lewis digunakan untuk menggambarkan ikatan kovalen dan ikatan kovalen koordinat. Struktur Lewis dikembangkan oleh Gilbert N.
Lewis.
Contoh
model titik Lewis yang menggambarkan ikatan kimia antara karbon C, hidrogen H,
dan oksigen O. Penggambaran titik lewis adalah salah satu dari usaha awal
kimiawan dalam menjelaskan ikatan kimia dan masih digunakan secara luas sampai
sekarang.
Unsur-unsur kimia dalam mencapai
konfigurasi seperti konfigurasi gas mulia dapat dilakukan dengan cara :
Proses Terbentuknya Ikatan Ion dan Kovalen
Proses Terbentuknya Ikatan Ion
Ikatan ion adalah ikatan yang terjdi akibat
adanya serah terima elektron sehingga membentuk ion positif dan negatif yang
konfigurasi elektronnya sama dengan gas mulia. Ikatan ion terjadi jika atom unsur yang memiliki energi ionisasi kecil/rendah
melepaskan elektron valensinya (membentuk kation) dan atom unsur lain yang
mempunyai afinitas elektron besar/tinggi menangkap/menerima elektron tersebut
(membentuk anion). Contoh ikatan yang terjadi antara Natrium dan Klorin.
Na+ + Cl- → Na+ Cl- → NaCl
IKATAN ION DAN IKATAN KOVALEN
IKATAN ION DAN IKATAN KOVALEN
Proses Terbentuknya Ikatan Ion
Ikatan ion adalah
ikatan yang terjdi akibat adanya serah terima elektron sehingga membentuk ion
positif dan negatif yang konfigurasi elektronnya sama dengan gas mulia. Ikatan
ion terjadi jika atom unsur yang memiliki energi
ionisasi kecil/rendah melepaskan elektron valensinya (membentuk kation) dan
atom unsur lain yang mempunyai afinitas elektron besar/tinggi
menangkap/menerima elektron tersebut (membentuk anion). Contoh ikatan yang
terjadi antara Natrium dan Klorin.
Na+
+ Cl- → Na+ Cl-
→ NaCl
Ciri-ciri
ikatan ion:
Langganan:
Postingan (Atom)