Menggambarkan rumus struktur pada
ChemSketch bagi sebagian orang yang menggeluti ilmu kimia tak semudah
menggambarkannya dengan alat tulis manual. Padahal teknologi komputer dibuat
adalah untuk memudahkan kerja sehingga lebih efektif dan efisien, praktis. Ini
adalah soal kebiasaan saja.
Seperti halnya menggambarkan ikatan
rangkap (double bond), saya contohkan adalah membuat ikatan rangkap antara C=C
pada etena atau etuna yang mempunyai ikatan rangkap tiga (triple bond). Setelah
membuat ikatan tunggal, dengan klik sekali dan seret kemudian lepaskan jadilah
struktur CH3-CH3, untuk membuatnya ikatan rangkap tinggal klik sekali pada
ikatan antara C-C maka akan menjadi ikatan rangkap C=C, kalau dikehedanki
ikatan rangkap tiga, klik sekali lagi pada ikatan rangkap tadi, jika mau
mengubahnya menjadi ikatan tunggal klik lagi sekali pada ikatan rangkap tiga
tadi. Mudah, tinggal klik-klik saja.
Sedikit berbeda ketika kita ingin membuat
ikatan rangkap antara C=O. Saya contohkan dalam menggambarkan rumus struktur
metanal (formaldehid) atau yang dikenal umum dengan formalin. Rumus molekulnya
H2CO. Kalau menggambarkannya dari CH4 kemudian langsung menggantikan satu H
dengan O, kemudian langsung kita ubah ikatan antara C-O menjadi ikatan rangkap
jelas tidak akan berhasil, meskipun kita sudah berusaha menghapus atom H tetap
tidak akan menyelesaikan masalah.
Secara
langsung begitu ikatan rangkap antara C-O tidak bisa dibuat
Tips yang sudah berhasil adalah dengan
menggambar H2C=CH2 terlebih dahulu. Ikatan rangkap antara C=C ini akan bisa
diubah menjadi ikatan rangkap C=O. Tinggal klik atom O pada menu samping,
kemudian klik C pada rumus yang sudah terbuat di layar kerja untuk
menstubtitusikan C dengan O. Hasilnya langsung terbentuk H2C=O dengan benar.
Agar rumus strukturnya terbentang, klik
menu Tools >> Add Explicit Hydrogens atau langsung menggunakan shortcut
Ctrl+Shit+Y.
Untuk menampilkan bentuk 3D dari struktur
2D tadi buka 3D Viewer ChemSketch. Cara membuka 3D Viewer ChemSketch tekan
tombol Alt+A+1. Tekan Alt+1 untuk ke ChemSketch 2D kemudian tekan Alt+2 untuk
mengkopi struktur 2D menjadi struktur 3D. Agar strukturnya tidak asal muncul,
lakukan 3D Optimization saat pada 3D Viewer caranya bisa menekan tombol
keyboard Alt+T+D.
Untuk menampilkan struktur 3D berbagai
model, klik saja toolbar wireframe, sticks, balls and sticks,spacefill, Dots
Only, Disk, with Dots.
Demikian
semoga bermanfaat
Tidak ada komentar:
Posting Komentar